Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSU72Q9NP77 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSU72Q9NP77 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms