Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms