Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXP3Q9BZS1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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