Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms