Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM2Q9BVW6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms