Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms