Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PRIMPOLQ96LW4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRIMPOLQ96LW4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms