Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PGLYRP3Q96LB9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGLYRP3Q96LB9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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