Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms