Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN19Q8N6F1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CLDN19Q8N6F1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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