Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LNX2Q8N448 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms