Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNTD2Q8IXW0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms