Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEK5Q6P3R8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms