Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf135Q5VTT2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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