Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRIP1Q5VSL9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms