Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms