Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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