Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms