Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRRQ15256 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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