Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC3Q15034 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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HERC3Q15034 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
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HERC3Q15034 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
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HERC3Q15034 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERC3Q15034 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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HERC3Q15034 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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HERC3Q15034 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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HERC3Q15034 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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HERC3Q15034 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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HERC3Q15034 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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HERC3Q15034 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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