Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms