Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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HNF4GQ14541 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HNF4GQ14541 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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