Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNGB1Q14028 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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