Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RUNX3Q13761 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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