Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.5 ms