Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM28Q13263 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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