Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXF1Q12946 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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