Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN2AQ12879 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN2AQ12879 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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