Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNH2Q12809 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms