Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KIF1AQ12756 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms