Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSRP1Q08945 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms