Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNB2Q08289 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNB2Q08289 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms