Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms