Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PPARDQ03181 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPARDQ03181 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms