Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD3P84022 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD3P84022 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms