Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIM1P81133 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIM1P81133 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIM1P81133 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIM1P81133 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SIM1P81133 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIM1P81133 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIM1P81133 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SIM1P81133 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms