Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASP9P55211 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASP9P55211 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASP9P55211 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CASP9P55211 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASP9P55211 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASP9P55211 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms