Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSEN1P49768 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms