Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms