Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIA3P42263 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms