Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5CP41229 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5CP41229 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms