Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD13P35453 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD13P35453 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms