Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC8P31273 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms