Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KDELR1P24390 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms