Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CCNA2P20248 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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