Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GM2AP17900 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms