Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CBSLP0DN79 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms