Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VIL1P09327 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VIL1P09327 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VIL1P09327 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms