Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PTPRCP08575 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PTPRCP08575 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRCP08575 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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