Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRBV12-3P01733 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms